Ovaj Odsjeka obavlja poslove koji se odnose na: koordinacija aktivnosti usklađivanja pravnog sustava Federacije BiH sa pravnom stečevinom Europske unije (acquis communautaire) iz nadležnosti Ministarstva; poslovi iz oblasti razvojnog planiranja i upravljanja razvojem u procesu europskih integracija, koordinaciju usklađivanja, te povezanosti razvojnog sa budžetskim planiranjem na nivou Federacije BiH, koordinacija projekata Ministarstva u procesu apliciranja prema EU fondovima sa svim institucijama u Federaciji BiH, suradnja u izradi operativnih programa, te projekata na osnovu kojih Ministarstvo postaje korisnik sredstava iz EU fondova, izrada i održavanje baze podataka o zainteresiranim stranama za konsultacije sa javnošću po pitanju europskih integracija i strateških planiranja na osnovu prijedloga dostavljenih od strane organizacijskih jedinica Ministarstva, sudjelovanje u radu grupa za pripremu programskih dokumenata za identifikaciju i formulaciju projekata za korištenje sredstava iz fondova EU i druge međunarodne razvojne pomoći, predlaganje projekata u skladu sa relevantnom procedurom; provođenje mjera za uspostavljanje, funkcioniranje i održivost decentraliziranog sustava upravljanja EU fondovima, suradnja sa međunarodnim donatorima kao i nadležnim nacionalnim institucijama radi osiguravanja podrške za programe i projekte koji doprinose ostvarivanju ciljeva iz nadležnosti Ministarstva, vršenje drugih poslova koji se odnose na djelokrug Europske unije, EU fondova i EU zakonodavstva.